O controlo das moscas como pragas urbanas, inclui quatro passos importantes:

1. Inspecção e identificação da espécie

É a fase vital já que permite conhecer aspectos importantes sobre a biologia e hábitos da espécie causadora da praga. Uma vez que o controlo de moscas envolve as larvas e os adultos o desconhecimento da espécie em causa torna mais difícil a identificação dos locais de reprodução. Por outro lado, se se combaterem os adultos sem se implementar qualquer acção contra as larvas, estas continuam a desenvolver-se perpetuando a infestação.

2. Implementação de medidas de higiene e saneamento

Independentemente dos progressos no controlo químico de moscas, as medidas de higiene e saneamento continuam a ser o melhor método de combate a estes insectos. Estas medidas são diversas, dependendo dos locais e das condições presentes, e incluem a desumidificação dos locais infestados, a limpeza dos locais de reprodução, a remoção de locais de descanso dos adultos, a remoção de lixos, dejectos de animais e outros materiais de origem vegetal ou animal em decomposição, etc. 

• Utilizar na iluminação exterior luzes menos atractivas para os insectos; 
• Colocar as fontes de iluminação exterior longe das portas e janelas; 
• Eliminar acumulações de matéria orgânica de humidade elevada (folhas, estrumes, etc.), especialmente em áreas potencialmente húmidas; – Cobrir sempre os alimentos; 
• Manter as cozinhas e os utensílios culinários limpos; 
• Eliminar locais de água paradas; 
• Remover e eliminar dejectos dos animais de estimação; 
• Não deixar nos alimentos destinados aos animais de estimação durante muito tempo nos comedouros; 
• Limpar regularmente as tubagens dos frigoríficos, aparelhos de ar condicionado, máquinas de lavar, etc.; 
• Utilizar desumidificadores em locais de humidade elevada; 
• Não guardar sem secar os panos e esponjas utilizados em limpezas; 
• Lavar bem todas as garrafas recicláveis de cerveja, vinho, vinagre, sumos de fruta, etc.; 
• Utilizar caixotes do lixo cujas tampas vedem bem e forrá-los com sacos de plástico; 
• Remover os lixos frequentemente; 
• Limpar frequentemente os caixotes do lixo; 
• No exterior manter o mais limpo possível as áreas destinadas aos lixos; 
• Colocar redes ou outras estruturas de protecção nas janelas e portas. As que abrem devem fazê-lo para o exterior; 
• Eliminar os excessos de vegetação em redor dos edifícios.

3. Implementação de medidas de controlo mecânicas

Fazem parte destas medidas de controlo a colocação de redes nas janelas, electrocutores de insectos, etc.

4. Aplicação de insecticidas

O controlo de moscas envolve frequentemente a aplicação de insecticidas em interiores e exteriores. De um modo geral as aplicações de insecticidas destinam-se a controlar as formas adultas já que a implementação de medidas de higiene e saneamento constitui a melhor forma de controlar as formas imaturas.